Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AGAP4Q96P64 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AGAP4Q96P64 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AGAP4Q96P64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
AGAP4Q96P64 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP4Q96P64 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP4Q96P64 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
AGAP4Q96P64 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms