Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RDH12Q96NR8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH12Q96NR8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH12Q96NR8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RDH12Q96NR8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms