Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ROBO3Q96MS0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ROBO3Q96MS0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ROBO3Q96MS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ROBO3Q96MS0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ROBO3Q96MS0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms