Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCMTD1Q96MG8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PCMTD1Q96MG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCMTD1Q96MG8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCMTD1Q96MG8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms