Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C12orf66Q96MD2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C12orf66Q96MD2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C12orf66Q96MD2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C12orf66Q96MD2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C12orf66Q96MD2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms