Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRIMPOLQ96LW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRIMPOLQ96LW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRIMPOLQ96LW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIMPOLQ96LW4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRIMPOLQ96LW4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms