Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDHR1Q96JP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDHR1Q96JP9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDHR1Q96JP9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDHR1Q96JP9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms