Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TPD52L3Q96J77 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TPD52L3Q96J77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TPD52L3Q96J77 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TPD52L3Q96J77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms