Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CMTM7Q96FZ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CMTM7Q96FZ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CMTM7Q96FZ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CMTM7Q96FZ5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms