Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUB1Q96FW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUB1Q96FW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUB1Q96FW1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms