Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IFT43Q96FT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFT43Q96FT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT43Q96FT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT43Q96FT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms