Protein–RNA interactions for Protein: Q96DE9

CXorf40B, Protein CXorf40B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40BQ96DE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CXorf40BQ96DE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CXorf40BQ96DE9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CXorf40BQ96DE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CXorf40BQ96DE9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CXorf40BQ96DE9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40BQ96DE9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CXorf40BQ96DE9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms