Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECHDC3Q96DC8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ECHDC3Q96DC8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ECHDC3Q96DC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ECHDC3Q96DC8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
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