Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL29Q96CT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHL29Q96CT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL29Q96CT2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL29Q96CT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL29Q96CT2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms