Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C3orf49Q96BT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C3orf49Q96BT1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf49Q96BT1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf49Q96BT1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms