Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM43Q96BQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM43Q96BQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM43Q96BQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM43Q96BQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM43Q96BQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms