Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VOPP1Q96AW1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VOPP1Q96AW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VOPP1Q96AW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VOPP1Q96AW1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms