Protein–RNA interactions for Protein: Q96A11

GAL3ST3, Galactose-3-O-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST3Q96A11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST3Q96A11 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST3Q96A11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
GAL3ST3Q96A11 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GAL3ST3Q96A11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GAL3ST3Q96A11 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms