Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF34Q969K3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF34Q969K3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RNF34Q969K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF34Q969K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF34Q969K3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms