Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTP4A1Q93096 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTP4A1Q93096 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTP4A1Q93096 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTP4A1Q93096 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms