Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNRQ92752 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
TNRQ92752 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNRQ92752 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
TNRQ92752 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
TNRQ92752 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNRQ92752 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNRQ92752 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNRQ92752 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
TNRQ92752 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
TNRQ92752 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNRQ92752 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNRQ92752 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
TNRQ92752 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
TNRQ92752 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNRQ92752 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNRQ92752 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
TNRQ92752 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNRQ92752 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
TNRQ92752 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
TNRQ92752 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TNRQ92752 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNRQ92752 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNRQ92752 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
TNRQ92752 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
TNRQ92752 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNRQ92752 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNRQ92752 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
TNRQ92752 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TNRQ92752 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNRQ92752 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNRQ92752 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNRQ92752 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNRQ92752 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TNRQ92752 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNRQ92752 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TNRQ92752 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNRQ92752 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TNRQ92752 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
TNRQ92752 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNRQ92752 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
TNRQ92752 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TNRQ92752 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNRQ92752 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNRQ92752 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
TNRQ92752 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNRQ92752 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNRQ92752 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TNRQ92752 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNRQ92752 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNRQ92752 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNRQ92752 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TNRQ92752 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TNRQ92752 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
TNRQ92752 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TNRQ92752 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNRQ92752 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNRQ92752 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TNRQ92752 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TNRQ92752 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TNRQ92752 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TNRQ92752 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNRQ92752 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TNRQ92752 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TNRQ92752 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TNRQ92752 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNRQ92752 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TNRQ92752 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TNRQ92752 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNRQ92752 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TNRQ92752 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNRQ92752 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TNRQ92752 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNRQ92752 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNRQ92752 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNRQ92752 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TNRQ92752 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNRQ92752 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
TNRQ92752 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TNRQ92752 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNRQ92752 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNRQ92752 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TNRQ92752 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
TNRQ92752 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNRQ92752 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNRQ92752 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TNRQ92752 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNRQ92752 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
TNRQ92752 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TNRQ92752 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms