Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATL1Q8WXF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATL1Q8WXF7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ATL1Q8WXF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATL1Q8WXF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms