Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC3

PYDC1, Pyrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYDC1Q8WXC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PYDC1Q8WXC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PYDC1Q8WXC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PYDC1Q8WXC3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYDC1Q8WXC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms