Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRUB1Q8WWH5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRUB1Q8WWH5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRUB1Q8WWH5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms