Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C15orf40Q8WUR7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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C15orf40Q8WUR7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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C15orf40Q8WUR7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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C15orf40Q8WUR7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C15orf40Q8WUR7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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C15orf40Q8WUR7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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C15orf40Q8WUR7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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C15orf40Q8WUR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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C15orf40Q8WUR7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C15orf40Q8WUR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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C15orf40Q8WUR7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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