Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUP133Q8WUM0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUP133Q8WUM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUP133Q8WUM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NUP133Q8WUM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP133Q8WUM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms