Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC12Q8WUD4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC12Q8WUD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC12Q8WUD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms