Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AGR3Q8TD06 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AGR3Q8TD06 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AGR3Q8TD06 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AGR3Q8TD06 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms