Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIN3Q8TB24 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIN3Q8TB24 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIN3Q8TB24 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIN3Q8TB24 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms