Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RP9Q8TA86 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RP9Q8TA86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RP9Q8TA86 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms