Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF1Q8NHV9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHOXF1Q8NHV9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOXF1Q8NHV9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RHOXF1Q8NHV9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms