Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BHLHE22Q8NFJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BHLHE22Q8NFJ8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BHLHE22Q8NFJ8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms