Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2CD4AQ8NCU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
C2CD4AQ8NCU7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2CD4AQ8NCU7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms