Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SPRYD3Q8NCJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPRYD3Q8NCJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPRYD3Q8NCJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SPRYD3Q8NCJ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SPRYD3Q8NCJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPRYD3Q8NCJ5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPRYD3Q8NCJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms