Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBR7Q8N806 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBR7Q8N806 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBR7Q8N806 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms