Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CSGALNACT2Q8N6G5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CSGALNACT2Q8N6G5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CSGALNACT2Q8N6G5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms