Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
IGSF1Q8N6C5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
IGSF1Q8N6C5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
IGSF1Q8N6C5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
IGSF1Q8N6C5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
IGSF1Q8N6C5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms