Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.2■■■■□ 3.87
VPS8Q8N3P4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.86
VPS8Q8N3P4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
VPS8Q8N3P4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.06■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
VPS8Q8N3P4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC39■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC38.97■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
VPS8Q8N3P4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
VPS8Q8N3P4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms