Protein–RNA interactions for Protein: Q8N140

EID3, EP300-interacting inhibitor of differentiation 3, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EID3Q8N140 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EID3Q8N140 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EID3Q8N140 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EID3Q8N140 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EID3Q8N140 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms