Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPICE1Q8N0Z3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPICE1Q8N0Z3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPICE1Q8N0Z3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms