Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR4Q8IZ21 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR4Q8IZ21 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHACTR4Q8IZ21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHACTR4Q8IZ21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHACTR4Q8IZ21 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHACTR4Q8IZ21 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms