Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SFTPA1Q8IWL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SFTPA1Q8IWL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SFTPA1Q8IWL2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SFTPA1Q8IWL2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms