Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC50Q8IVM0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC50Q8IVM0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC50Q8IVM0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC50Q8IVM0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC50Q8IVM0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms