Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FOXP4Q8IVH2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FOXP4Q8IVH2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FOXP4Q8IVH2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
FOXP4Q8IVH2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
FOXP4Q8IVH2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms