Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IFNEQ86WN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFNEQ86WN2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IFNEQ86WN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IFNEQ86WN2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
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