Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FAM228AQ86W67 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAM228AQ86W67 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM228AQ86W67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM228AQ86W67 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms