Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE9

PCGF5, Polycomb group RING finger protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF5Q86SE9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCGF5Q86SE9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCGF5Q86SE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCGF5Q86SE9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCGF5Q86SE9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms