Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
APTXQ7Z2E3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
APTXQ7Z2E3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
APTXQ7Z2E3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APTXQ7Z2E3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms