Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BHLHA9Q7RTU4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHLHA9Q7RTU4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BHLHA9Q7RTU4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BHLHA9Q7RTU4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BHLHA9Q7RTU4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms