Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEM1Q6ZVN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SEM1Q6ZVN7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEM1Q6ZVN7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms